2021年にTBS日曜劇場枠で放送されたドラマ『TOKYO MER～走る緊急救命室～』の劇場版第2作。
ドラマでは、鈴木亮平演じる医師・喜多見幸太が、「待っているだけじゃ、助けられない命がある」という信念のもと、切迫した状況でも常に冷静沈着にメンバーを引っ張り、どんな苦境にも飛び込んでいく姿が大きな感動を呼んだ。さらに、2023年4月に公開された劇場版第1作も大ヒットを記録。
その続編である本作では、数多の命を救ってきたMERメンバーが大海原を舞台にした史上最大のミッションに挑むことに。沖縄・鹿児島にまたがる海に浮かぶ島々を巡る“南海MER”が誕生し、メンバーが医療の行き届かない離島医療に従事する中、とある火山島で大規模な噴火が発生し、全島民79名が命の危機に陥る。喜多見は、そして新しいMERメンバーたちは、果たしてすべての命を救うことが出来るのか？あの医療従事者（ヒーロー）たちの熱き戦いが、再び始まる。

【映画ストーリー】
2025年、これまでの実績が評価され、全国の主要都市である札幌・仙台・名古屋・大阪・福岡に新たなMERが誕生していた。一方、沖縄・鹿児島では離島地域に対応できるMERの誘致活動が活発化。オペ室を搭載した特殊車両＝NK1を乗せたフェリーで、南の海の島々を巡る“南海MER”の試験運用が開始された。
TOKYO MERチーフドクターの喜多見、看護師の夏梅は指導スタッフとして南海MERに赴任し、医療が行き届かない離島医療に従事していた。
そんなある日、とある南の島で突如として大規模な噴火が発生…。溶岩が村を焼き尽くし、飛び交う巨大な噴石が道路や建物を破壊する。噴煙のため、ヘリコプターによる上空からの救助は不可能。そして海上自衛隊や海上保安庁の到着には、なお数十分を要する…。
絶望的な状況の中、島に取り残された79名の全員の命を救うため、南海MERは決死のミッションに挑んでいく。

【本編：115分】

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