DDSのクラス決定試験が近づいてきた。
　DDSでは成績次第でしばしクラス替えが行われる。ウカウカしていれば特別待遇のQクラスのメンバーといえども、他のクラスに移動ということもありうるのだ。ちょっとあせる一同の前に、いつかの『霧咲島特別課外授業』で一緒になった、Aクラスのメンバーが現れる。これまでにいくつもの事件の解決に協力し、それぞれに特技を持つ彼らは、特別待遇のQクラスに対してあからさまに敵意むき出しといった態度だ。
　あまりのことに腹を立てたキンタは、つい「次の試験まで待たなくても今ここで決着をつけてやる！」と口走ってしまう。そこに偶然、団が現れる。団はその決着をつけるのに、「私が出題する問題を互いに推理しあう推理バトルをしないか」と提案する。
　対決は『事件現場再現教室』で行われることになった。問題は、『神隠し村（かみかくしむら）』という村で発生した『大学生の空中失踪事件』の解明だ。
　教室に用意された事件現場のジオラマや、被害者の持ち物をカードにしたものなど、さまざまな資料を使った、Qクラス対Aクラスの推理バトルがいよいよ始まった！